※20140921追記
ごめんなさい、下記の記事でもGPSは動いていませんでした。でもrootをとってcriticalなファイルの編集方法として有用なのでそのままにします。
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SO-03Dで4.1（海外版）にするとGPSの設定がsupl.sonyericsson.comになるが、なぜかこれじゃダメらしいのでsupl.google.comにする必要があるらしい。
しかしGPSの設定を変えるのにはrootedがいるらしい。
嫌な予感……。
まずは、
名無しの雑記帳Blog: XPERIA各種のroot化方法&CWM/TWRP導入方法まとめ
ここからrootを取るapkをDLしてPCからSO-03Dにapkをコピーする。（downloadフォルダでいいだろう）
次にファイラーで上記apkを実行してアドレス取得→rootedにする。
再起動したら、SuperSUがあれば成功である。
次にファイラーでsystemディレクトリを書き込み可にする。
ESファイルエクスプローラー:Root Explorerの機能を無料で使えるアプリ。
あとは
/system/etc/gps.conf
を開いて、
上部を
NTP_SERVER=jp.pool.ntp.org
XTRA_SERVER_1=http://xtra1.gpsonextra.net/xtra.bin
XTRA_SERVER_2=http://xtra2.gpsonextra.net/xtra.bin
XTRA_SERVER_3=http://xtra3.gpsonextra.net/xtra.bin
下部を
SUPL_HOST=supl.google.com
SUPL_PORT=7276
に変更する。（ここを間違えるとGPS起動した瞬間にXPERIAが落ちる）
保存するとなぜかパーミッションがおかしくなることがあるので-RW-R--R--
に直す。
ついでにrootedだと都合が悪い人は
/system/app
にあるSuperuser.apkをリネームして、SuperSUを無効にすれば良い。
それでもダメなら/system/bin/su・ /system/xbin/su・ /sbin/suあたりがないか見てあれば除去。
※上記行為をすると鉄板でドコモのサポートが無効になるので注意。（もっとも海外の4.1入れてる時点でとっくに無効だが）
それにしてもとんでもない手間である。「ちょっとSO-03Dを4.1にするか」と思っただけでrootedまで必要とは。
